دن کُزو و دراگونُید برای مبارزه ای بزرگ علیه رقیب دیرینه شان نیلیوس آماده می شوند، در حالی که تاریخچه ای از چگونگی آمدن باکوگان به زمین فاش می شود. باکوگان ها در سراسر جهان یاد می گیرند که با شرکای انسانی خود از جمله میا اونُو و باکوگان ون تری، همراه شوند.

دن، میا و گریفین به منظور تحقیق درباره ورود جدید باکو-بال به زمین به محل می روند، اما باید از دست چیپ و واحد گشت او فرار کنند ولی باکوگان از بسته بندی خارج شده و در تطابق با محیط جدیدش دچار مشکل می شود.

وقتی دن متوجه می شود که میا هویت مبارزه ای خود را از خانواده اش مخفی کرده و میا نیز متوجه می شود که دن به دراگون کلن مد رفته است، درگیری ای بین این دو شکل می گیرد.

در نیاز شدید به مبارزان بیشتر، قبیله میسفیت از یک هکر ماجراجو به نام جونو درخواست می کند تا به تیمشان بپیوندد، اما قبیله پستانداران نیز می خواهد او را به تیم خود جذب کند.

وقتی مورف و لیل جاسپر شب را به تنهایی در مد دست تنها سپری می کنند، باید با نفوذگران مقابله کنند. سپس، قبیله میسفیت باید مقابل قبیله دینو قرار بگیرد.

دن سوژه خنده در فضای مجازی شده است و دراگو سعی دارد که او متوجه این قضیه نشود تا دوستانشان ویدیوها را از اینترنت پاک کنند.

یک مبارز جوان از قبیله آبزیان و شریک باکوگانش، اکتوگان، برای درخواست یک لطف غیرمنتظره به مد دست تنها می آیند.

تی سی، تازه ترین عضو قبیله میسفیت، با هیجان برای دیدن دنیای بیرون همراه با هامرهد به یک پارک محلی می رود، اما وقتی با چیپ و واحد گشت باکوگانش روبه رو می شود، گرفتار دردسر می شود.

جونو و تی سی به خیابان ها می روند تا با چندین قبیله مختلف درگیر شوند و به این ترتیب به تی سی کمک کنند تا در مبارزات پیشرفت کند.

وقتی میا متوجه می شود که یک مبارز در اینترنت از او سو استفاده کرده، او را به مبارزه در مد قبیله میسفیت دعوت می کند و در نهایت با چالشی بیشتر از آنچه انتظار داشت روبه رو می شود.

قبیله میسفیت تلاش می کند تا مکان مسابقات مبارزه باکوگان را پیدا کند، اما این باعث می شود تی سی و هامرهد در عمق دردسر فرو بروند.

دراگو داستان تاریخچه اش با نیلیوس را بازگو می کند و جنگی را شرح می دهد که باعث شد باکوگان ها به زمین منتقل شوند.

بعد از فاش شدن یک راز آسیب زننده، دن و دراگو به کِیِج و نیلیوس چالش می دهند تا برای سرنوشت قبیله میسفیت مبارزه کنند.

دولت تلاش می کند تا تمام باکوگان ها را بی اثر کند؛ سپس یک هولوگرام از یک دروازه مرموز بیرون می آید با پیامی از یک مرد مرموز که صورتش را ماسک پوشانده است.

تیم تلاش می کند تا بیشتر درباره پدر میا و نقش او در حمله باکوگان ها اطلاعات کسب کند؛ در همین حال، میا سعی می کند توانایی های باکوگانش را بازگرداند.

وی یک مسابقه جدید باکوگان اعلام می کند تا مشخص شود کدام قبیله قدرتمندترین است؛ در حالی که دن ناراحت است که فرصتی برای مبارزه پیدا نکرده است.

تی سی برای جایگزینی جونو پس از آسیب دیدگی اش قدم پیش می گذارد؛ گریفین، تروکس را ترغیب می کند که برای یک بازی در تبلیغ نوشیدنی انرژی زا تست بدهد.

سلاحی آزمایشی باعث می شود باکوگان ها به زمین منتقل شوند و انسان ها از آن ها استقبال کنند. وقتی نوجوانان با باکوگان ها همراه می شوند، توانایی یافتن اندازه ای غول پیکر را به دست می آورند، اما جهان به زودی با فاجعه ای بزرگ روبه رو می شود.

در راه بازگشت به مد، ونتری به طرز مرموزی دوباره به حالت باکو-بال در می آید و نمی تواند از آن خارج شود، که باعث می شود یک سفر بی برنامه و خطرناک در سراسر شهر آغاز کند.

در راه بازگشت به مد، ونتری به طرز مرموزی دوباره به حالت باکو-بال در می آید و نمی تواند از آن خارج شود، که باعث می شود یک سفر بی برنامه و خطرناک در سراسر شهر آغاز کند.

سلاحی آزمایشی باعث می شود باکوگان ها به زمین منتقل شوند و انسان ها از آن ها استقبال کنند. وقتی نوجوانان با باکوگان ها همراه می شوند، توانایی یافتن اندازه ای غول پیکر را به دست می آورند، اما جهان به زودی با فاجعه ای بزرگ روبه رو می شود.

سلاحی آزمایشی باعث می شود باکوگان ها به زمین منتقل شوند و انسان ها از آن ها استقبال کنند. وقتی نوجوانان با باکوگان ها همراه می شوند، توانایی یافتن اندازه ای غول پیکر را به دست می آورند، اما جهان به زودی با فاجعه ای بزرگ روبه رو می شود.

سلاحی آزمایشی باعث می شود باکوگان ها به زمین منتقل شوند و انسان ها از آن ها استقبال کنند. وقتی نوجوانان با باکوگان ها همراه می شوند، توانایی یافتن اندازه ای غول پیکر را به دست می آورند، اما جهان به زودی با فاجعه ای بزرگ روبه رو می شود.

سلاحی آزمایشی باعث می شود باکوگان ها به زمین منتقل شوند و انسان ها از آن ها استقبال کنند. وقتی نوجوانان با باکوگان ها همراه می شوند، توانایی یافتن اندازه ای غول پیکر را به دست می آورند، اما جهان به زودی با فاجعه ای بزرگ روبه رو می شود.

ویرانگر وی ادامه دارد و دن از دیگران درخواست کمک می کند. گریفین، جونو و پدر میا در تلاشند تا دستگاهی بسازند که بتواند اوضاع را کنترل کند.

دراگو با نیلیوس مبارزه می کند تا نقشه او برای تسلط بر جهان را متوقف کند. قبیله ها دست به دست هم می دهند تا برای همیشه نیلیوس را شکست دهند.